MS-06S是以MS-06F型为基础专门为中队指挥官以上的王牌驾驶员制造的机体。在技术改进方面，主要提高了推进剂的燃烧效率、制御系统的控制效率以及通信系统等。燃烧效率的提高不仅使机体的推力较普通的F型上升了30%，而且也提高了燃料的装载量。本型生产了100架左右，驾驶员中最为著名的当属“赤色彗星”夏亚·阿兹纳布。

机体番号：	MS-06S
机体代号(日文)：	ザクⅡ（指揮官機）	英文：	Zaku Ⅱ Commander Type	中文：	指挥官用型扎古Ⅱ
出现作品：	机动战士高达（0079）
机体类型：	泛用量产型MS
制造商：	吉恩尼克公司
所属：	吉恩
初次配备：	U.C.0079
技术参数
内部环境：	标准式驾驶舱
尺寸：	头顶高：17.5米 全高：18.0米
重量：	本体重量：56.5吨 全备重量：75.2吨
装甲材料及结构：	超高张力钢（超硬钢合金）
发电机出力：	976KW
推进力：	51600KG
加速度：	0.69G
装备及设计特征：	传感器探测有效半径：3200米
固定武装：
选用武装：
选用手部武器：	120mm机枪，弹鼓供弹，100发1弹鼓，备用弹鼓收纳于后方裙甲上；280mm火箭筒，4发1弹舱，收纳于后腰装甲上；热能斧，收纳于侧面裙甲上
远程武器：