每当有皮克斯电影上映，找彩蛋也成了影迷热衷的娱乐活动。《海底总动员2》自然也不例外，色彩斑斓的海底世界同样充斥着皮克斯粉丝们熟悉的“声影”。

1. 上集给尼莫配音的Alexander Gould如今已经21岁了，声线显然已经不再适合继续配尼莫。然而剧组依然找到了让他回归的方法，那辆将鱼儿们运往克利夫兰的货车的司机就是Gould配音的。

2.汉克与多莉第一次见面的时候，介绍方式非常具有特工范。汉克的开场白是“The name's Hank”，模仿了经典特工007的口头禅“The name's Bond”。

3.隔离中心的墙上出现许多熟悉的面孔。上集里牙医侄女朵拉的照片，咖啡机下面的冰箱上贴着一张明信片，上面印着皮克斯2015年短片《熔岩》里那座会唱歌的火山。

4.续集中，导演安德鲁·斯坦顿继续给海龟Crush配音，把“Dude”挂在嘴边。而小丑鱼父子在海洋生物研究所里遇见的那只失恋又话唠的蛤蜊，同样是安德鲁的声音。

5.海洋生物研究所里可以见到一根刻着“Seawater Supply TL59”字样的水管，这是在向迪士尼乐园里海底总动员潜艇之旅区致意，游客在排队的时候，能看到一模一样的水管横在头顶上方。

6.海底沉了一辆疯狂金龟车，来自迪士尼《万能金龟车》的模型，同样是皮克斯电影中经常出现的彩蛋形象。

7.两部《海底总动员》电影都有一只酷爱剪草的螃蟹，续集这只除草的螃蟹由皮克斯固定配音客串约翰·拉岑贝格献声。

8.汉克带多莉逃离隔离检疫区的时候，背景的墙上出现了一只雏鸟的海报，它就是皮克斯最新动画短片《鹞》的主人公，这支短片在北美是与《海底总动员2》贴片上映的。

9.深海探秘区天花板上挂着很多来自上集的海洋动物形象，包括海龟Crush的模型、鲨鱼、跨越海洋八卦马林寻子的海豚等等。

10.汉克将多莉放回深海探秘的水域时，远处墙上挂着印有WALL.E字样的日历。

11.将多莉打捞起来的救生艇侧面印着1200和86两组数字，前者代表皮克斯总部的地址“公园大道1200号”，后者是皮克斯成立的年份1986年。

12.所有皮克斯电影都能见到的A113彩蛋，在《海底总动员2》出现过两次。比较明显的是那样开往克利夫兰的运输车，镜头多次切到车头与车尾的牌照“CAL A113”，代表皮克斯元老们毕业的加州艺术学院动画系A113教室。另一处被安插在两只海狮身上，弗卢克和鲁德尔尾巴贴着的标签数字一个是A1，一个是13。

13.皮克斯动画的固定彩蛋披萨星球外卖车也在片中出现了两次，第一次是在影片开头那只会发光的巨型八爪鱼身边，第二次藏在最后章鱼汉克和多莉驾车逃跑时差点迎面撞上的车辆群众。

14.来自电视剧的搭档：给霸道海狮弗卢克和鲁德尔配音的是《火线》主演，伊德瑞斯·艾尔巴与多米尼克·韦斯特；给章鱼汉克与白鲸贝利配音的是《摩登家庭》岳父女婿二人组——艾德·奥尼尔与泰·布利尔；多莉寻亲路上遇到的夫妻鱼，是《周六夜现场》的常驻演员比尔·哈德尔与凯特·迈克金农配音，凯特本人也非常擅长模仿为多莉配音的电视名嘴艾伦·德詹尼斯。

15.海洋研究所广播里循环广播的宣传语是由“异形女王”西格妮·韦弗本色配音，韦弗一直非常热衷为自然环保宣传片录旁白，是美国著名的“自然代言人“。中文版这个角色的配音则由足球解说界的名嘴黄健翔担当。

16.片尾字幕结束之后，上一集牙医诊所鱼缸的尼莫”缸友“们终于从悉尼游到了加利福尼亚，结果没能逃离被人类带走的命运。